《异度传说 THE ANIMATION》是一部以西元20XX年为背景的动画片，由古賀豪执导，主演包括前田爱、鈴木麻里子、江原正士等。故事始于人类在肯亚图尔卡纳湖发现一件名为索哈尔（Zohar）的神秘物体，并展开了对其的研究。通过重建神之语言并开发电脑程序，人类尝试启动索哈尔，并进行与上位领域存在的U-DO（红色波动）的连接实验。然而，这一试验意外引发了能量波动，几乎将地球消失在宇宙中，并迫使人类逃离地球。四千多年后，米尔奇亚行星爆发了米尔奇亚冲突事件，人类似乎在冲突中遭到格诺西斯的袭击，并在冲突结束后消失。然而，米尔奇亚行星的消失带走了真相，事件真相至今未为世人所知。在此事件之后，启动索哈尔所需的神之语言、索哈尔的研究成果以及米尔奇亚行星的U.M.N.坐标等信息都被封存在Y资料中，并将Y资料封存在百式观测用合成人M.O.M.O.的意识内部。然而，这一举动引发了各方势力对M.O.M.O.的争夺。为此，星团联邦政府雇佣了一个名叫Ziggurat 8的生化人来保护M.O.M.O.的安全。与此同时，贝克达公司以对抗格诺西斯入侵为名，进行了KOS-MOS战斗兵器的开发计划。不同于当时多使用合成人和生化人的情况，KOS-MOS是纯机械制品。在EPI开始时，参与KOS-MOS开发计划的贝克达公司第一开发局研究员卯月紫苑正在Woglinde号太空船上旅行，该船搭载了还未正式启动过的KOS-MOS。然而，在一次突如其来的格诺西斯袭击中，KOS-MOS突然启动，将卯月紫苑卷入了一系列与格诺西斯和索哈尔有关的阴谋，并将改变人类命运的事件中……
