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在《黄昏少女×失忆》中，探讨了一个校园中神秘事件的故事。这个故事背景设定在诚教学园初中部，一个历史悠久的学校，这里频频上演着让人摸不着头脑的事件。主人公新谷真一在一个黄昏时分迷失在校舍中，偶然间遇到了一个黑发少女。少女穿着陈旧的校服，眼神中充满了无尽的哀伤，让真一感到不寻常。他心中猜测，这是否是一个幽灵的出现？原来，这位少女名叫庚夕子，在15岁时不幸去世，丧失了所有记忆。她每天徘徊在校园中，成为许多神秘事件的始作俑者。真一成为唯一能看见庚夕子的人，并成为了解开这个谜团的关键人物。他决定组建一个名为“灵异调查部”的社团，以寻找庚夕子失去的记忆，解开校园神秘事件的真相。